La asociación de padres y madres del alumnado (APYMA) es el órgano representativo de las familias dentro del Colegio Juan de Palafox.
Pertenecen a la APYMA todas las familias del alumnado del centro que lo deseen y que paguen la cuota establecida (actualmente 15 € por familia), con los mismos derechos y obligaciones. Se establecen dos tipos de socios:
1.- Familias cuyos hij@s están matriculados en el Colegio.
2.- Familias con hij@s en edad escolar que, sin pertenecer a nuestro Colegio, ni vivir en Fitero, pueden ser soi@s de la APYMA y participar en nuestras actividades «Apymeros por el mundo».
La APYMA del Colegio Juan de Palafox esta asociada a la federación de apymas British Til, asociación que defiende la enseñanza pública, gratuita y bilingüe (castellano-inglés)
La Junta Directiva de la APYMA del Colegio Juan de Palafox está formada por:
| Presidenta | María Garraleta Berdonces |
| Vicepresidenta | Sandra Mendoza Lamarca |
| Secretaria | Antonieta Berdonces Fernández |
| Tesorera | María Jesús Navascués Muro |
| Vocal | María Pilar Embid Salvador (Consejo Escolar) |
| Vocal | Josefina Hernández Galán |
| Vocal | Jesús Mª Yanguas Berrozpe |
La Junta Directiva de la A.P.Y.M.A. en una de las múltiples actividades que organiza.